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您的细胞做过STR鉴定吗？

Time：2024-04-19
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您的细胞做过STR鉴定吗？

科研汪们废寝忘食、不分昼夜地做实验搞科研，数据、文章都完美无瑕。到最后投稿这一哆嗦，期刊要求必须出具细胞株STR鉴定报告，实验汪们那时才意识到科研竟有如此骚操作~

急急忙忙做鉴定，结果竟是其他细胞（大部分是万恶的Hela细胞），此时才万念俱灰�。。�

 

什么是细胞株STR鉴定？

STR（Short Tandem Repeat）即短串联重复序列，其基因位点是由长度为3～7个碱基对的短串连重复序列组成，这些短串联重复序列广泛存在于人类基因组中，可作为高度多态性标记，被称为细胞的DNA指纹。

为什么要做STR鉴定？

据统计约30%细胞系被交叉污染或错误辨识，因使用了交叉污染或错误辨识的细胞而导致研究结论错误、结果不可重复、临床细胞治疗灾难性后果……，这浪费大量时间、精力和金钱。因此，科研汪们最好在开展课题前提早做细胞株鉴定，确定细胞是否存在问题；而阶段性的鉴定也是必须的，因为细胞经过反复传代后（5代以上），突变和交叉污染的几率极大。

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细胞株STR鉴定流程

（1）  首先是提取细胞的基因组DNA，提取后需进行质量鉴定，即OD260/OD280=1.8-2.0；

（2）  荧光引物PCR扩增STR位点；

（3）  扩增产物经过毛细管电泳，获得细胞基因的分型结果；

（4） STR的数据库比对，比对数据库为美国的ATCC细胞库，德国的DSMZ细胞库，日本的JCRB细胞库；

 1.jpg

STR鉴定案例——THP-1细胞STR鉴定分析

1、细胞THP-1的STR分型图谱

2.jpg

2、STR 位点分型结果

基因位点

检测样本数据

ATCC数据


THP-1

THP-1

Amelogenin

X

Y

X

Y

CSF1PO

11

13

11

13

D13S317

13

13

13

13

D16S539

11

12

11

12

D5S818

11

12

11

12

D7S820

10

10

10

10

THO1

8

9.3

8

9.3

TPOX

8

11

8

11

vWA

16

16

16

16

检测样本位点数据与ATCC标准数据的匹配率为100%

样品提供：

细胞悬液(细胞数≥106个)或基因组DNA(体积≥20μl，浓度≥50 ng/μl)。

结果交付：

STR分型的图谱和检测结果的书面报告。

咨询/订购：（如有任何相关问题，请联系我们的工作人员，我们即刻为您解答和服务。）

热线电话：0755-86325431  

邮箱: sales@topbiotech.com.cn

网站：www.topbiotech.com.cn

 

文献引用参考

1．Authentication testing of HEK 293T and HeLa cell lines have been performed by Shanghai Biowing Applied Biotechnology Co.,Ltd via STR profiling. STR profiles match the standards recommended for HEK 293T and HeLa cell lines authentication

2．AGS, NCI-N87, HGC-27 and HEK293 were STR-authenticated on Dec. 8, 2015 by Shanghai Biowing Applied Biotechnology Co. LTD, Shanghai, China


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